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研究成果 2007 2019

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公開
Metagenome
Bacterial Genomes
Base Composition
Libraries
Metagenomics
1 引用 (Scopus)

Evaluation of SNP calling methods for closely related bacterial isolates and a novel high-accuracy pipeline: BactSNP

Yoshimura, D., Kajitani, R., Gotoh, Y., Katahira, K., Okuno, M., Ogura, Y., Hayashi, T. & Itoh, T., 5 1 2019, : : Microbial Genomics. 5, 5

研究成果: ジャーナルへの寄稿記事

公開
Single Nucleotide Polymorphism
Genome
Benchmarking
Disease Outbreaks
Bacteria

Genome sequencing verifies relapsed infection of helicobacter cinaedi

Sawada, O., Gotoh, Y., Taniguchi, T., Furukawa, S., Yoshimura, D., Sasaki, S., Shida, H., Kusunoki, Y., Yamamura, T., Furuya, K., Itoh, T., Horita, T., Hayashi, T. & Misawa, N., 1 1 2019, : : Open Forum Infectious Diseases. 6, 5

研究成果: ジャーナルへの寄稿記事

公開
Helicobacter Infections
Genome
Infection
Single Nucleotide Polymorphism
Clone Cells

Genomic Features of Rickettsia heilongjiangensis Revealed by Intraspecies Comparison and Detailed Comparison With Rickettsia japonica

Kasama, K., Fujita, H., Yamamoto, S., Ooka, T., Gotoh, Y., Ogura, Y., Ando, S. & Hayashi, T., 12 6 2019, : : Frontiers in Microbiology. 10, 2787.

研究成果: ジャーナルへの寄稿記事

公開
Rickettsia
Ticks
Single Nucleotide Polymorphism
China
Fever
1 引用 (Scopus)

Large-scale genome analysis of bovine commensal Escherichia coli reveals that bovine-adapted E. Coli lineages are serving as evolutionary sources of the emergence of human intestinal pathogenic strains

Arimizu, Y., Kirino, Y., Sato, M. P., Uno, K., Sato, T., Gotoh, Y., Auvray, F., Brugere, H., Oswald, E., Mainil, J. G., Anklam, K. S., Döpfer, D., Yoshino, S., Ooka, T., Tanizawa, Y., Nakamura, Y., Iguchi, A., Morita-Ishihara, T., Ohnishi, M., Akashi, K. および2人, Hayashi, T. & Ogura, Y., 1 1 2019, : : Genome Research. 29, 9, p. 1495-1505 11 p.

研究成果: ジャーナルへの寄稿記事

公開
Enteropathogenic Escherichia coli
Genome
Escherichia coli
Virulence
Enterocytes